Proteomica Cellulare e Principi di Proteomica (LM Bioinformatica 6 CFU)

Prof Andrea Battistoni

Scopo del corso: Il corso ha l’obiettivo di introdurre gli studenti alle metodiche di base utilizzate in proteomica e alle sue diverse applicazioni nella ricerca biologica

Programma: Struttura ed organizzazione del proteoma. Cenni sulle tecniche di base per studiare il proteoma cellulare (purificazione di proteine, elettroforesi monodimensionale e 2D, Western blot, immunoprecipitazione, immunoistochimica, sequenziamento con degradazione di Edman, principi di spettrometria di massa). Metodi avanzati per lo studio del proteoma. Modificazioni post-traduzionali delle proteine e loro significato fisio-patologico. Redox proteomica: metodologie per l’identificazione di proteine modificate ossidativamente. Applicazioni della proteomica per lo studio di base di sistemi procariotici ed eucariotici, per l'analisi delle interazioni tra ospite e patogeno e per la comprensione delle basi molecolari delle malattie.

Test in itinere: preparazione di una presentazione powerpoint di crca 20 minuti su un argomento scelto dal docente

Esame finale: Orale

Testo: Principles of Proteomics (2nd Edition). Autore Richard Twyman. Edito da Garland Science

Cellular Proteomics and Principles of Proteomics (LM Bioinformatics 6CFU)

Aim: The course aims to introduce students to the basic methods used in proteomics and to the various applications of proteomics to biological research

Program: Structure and organization of the proteome. Introduction to the basic techniques for studying the cellular proteome (protein purification, one- and two-dimensional electrophoresis, Western blot, immunoprecipitation, immunohistochemistry, sequencing by Edman degradation, principles of mass spectrometry). Advanced methods for the study of the proteome. Posttranslational protein modifications: role and pathophysiological significance. Redox proteomics: methods for the identification of oxidatively modified proteins. Applications of proteomics to the study of prokaryotic and eukaryotic systems, for the analysis of the host-pathogen interaction and for the comprehension of the molecular basis of disease.

Test in progress: Preparation of a 20 min powerpoint presentation on one topic selected by the professor

Final Exam: Oral

Book: Principles of Proteomics (2nd Edition). Autore Richard Twyman. Edito da Garland Science